Drie computerwetenschappers van mic.brussels lopen stage bij de 101 Genomes Foundation
Vier maanden lang kreeg de 101 Genomes Foundation (F101G) hulp van drie jonge informatici die een nieuw concept kwamen ontwikkelen in het kader van een stage georganiseerd door mic.brussels (My innovation centre.Brussels). Elk jaar selecteert mic.brussels samen met Brusselse IT-scholen de beste mensen om deel te nemen aan het innovatieprogramma. Zo brengt mic.brussels jonge ontwikkelaars en Brusselse bedrijven samen om een IT-ecosysteem in Brussel te ontwikkelen. In 2021 kon F101G zijn IT-ontwikkeling versnellen door deel te nemen aan het innovatieprogramma mic.brussels. Sabine ontmoette voor de F101G de drie mic.brussels stagiairs Luis Save Lara (LSL), Matthieu Kisiel (MK) en Fabien Hance (FH) om hun ervaringen met de F101G te bespreken.
Welke training heb je gevolgd ?
LSL : We zijn met z’n drieën een bachelor in business computing aan het afronden – analist programmeur bij de EPFC in Brussel. We liepen stage bij F101G als onderdeel van onze opleiding. Bij EPFC leiden we op tot ontwikkelaar in drie jaar. We volgen voornamelijk programmeercursussen, maar ook cursussen in boekhouden, SAP, communicatie, auteursrecht en computernetwerken. We profiteren van de ervaring van geweldige docenten die zeer competent en motiverend zijn.
FH: Op persoonlijke titel wil ik hieraan toevoegen dat ik me na mijn studie bedrijfskunde en mijn eerste werkervaring echt bewust ben geworden van het belang van IT, zowel voor een verkoopsite als voor de ontwikkeling van machines etc. Het is voor mij een echte uitdaging om op de hoogte te blijven van de nieuwste ontwikkelingen. Dus om iets meer te begrijpen van deze wereld, die me ingewikkeld leek, schreef ik me in voor avondlessen voor de bachelor in bedrijfsinformatica aan de EPFC.
Wat heeft mic.brussels voor jou betekend naast je training ?
LSL: mic.brussels heeft me geholpen om een stageplaats te vinden, wat niet gemakkelijk is tijdens de covidiode. Dankzij de hulp van de mic.brussels coaches heb ik het Azure platform leren gebruiken en heb ik ook mijn kennis als full stack developer verdiept.
MK : Ik ontdekte mic.brussels tijdens een videoconferentie. Ik heb gesolliciteerd en ben door de selectieprocedure gekomen. Bovenal biedt mic.brussels begeleiding en ondersteuning tijdens de stage, inclusief aanvullende training en de zekerheid van voldoende praktijkervaring om de stage aan het einde van de cursus te valideren.
FH : Nadat we gesolliciteerd hadden, hadden we een tweedelige test : eerst een technische ontwikkelingsoefening van 3 uur en daarna een interview. Toen bracht mic.brussels ons in contact met de 101 Genomes Foundation.
Hoe is je cursus georganiseerd ?
LSL : We werken fulltime : twee dagen per week bij mic.brussels en drie dagen bij de 101 Genomes Foundation. Er worden regelmatig bijeenkomsten gehouden tussen mic.brussels en F101G om moeilijkheden te bespreken en hoe deze kunnen worden opgelost. De 2 dagen bij mic.brussels zijn gewijd aan werk voor de Foundation, maar onder toezicht van onze coaches.
FH : Vier of vijf coaches, elk met expertise op verschillende gebieden, zoals databases, de meer visuele aspecten, etc. begeleidden ons. Elke week was er een voortgangsrapport en een follow-up die ons in staat stelden om de timing en de doelstellingen te zien en te bereiken, een beetje zoals een metronoom. Het is belangrijk omdat we soms verzanden in details. Hier begonnen we met een blanco pagina in termen van ontwikkeling… dus het was belangrijk om de steun van coaches te hebben om ons te helpen met onze technologische keuzes, maar ook om een mening te hebben of om ons op het juiste spoor te zetten in geval van problemen.
Wat waren de hoogtepunten van je stage? En wat leer je hiervan voor de rest van je carrière? professioneel ?
LSL : Een lonende stage, zowel professioneel als persoonlijk. De waarden van de F101G deel ik voor 100%. Ik heb veel geleerd over het menselijk genoom en al zijn verborgen mogelijkheden, die nog volledig moeten worden benut. Wat ik ervan heb geleerd is dat werken in een kleine organisatie en een project vanaf nul uitvoeren het pad is dat bij me past en dat ik de rest van mijn carrière zal volgen.
MK : Ik heb zowel technische dingen geleerd over de gebruikte technologie als over genetisch onderzoek. Wat ik van deze stage meeneem voor mijn carrière is de ervaring van het opvolgen van de klant voor wie het project wordt ontwikkeld. Je moet dus met de klant blijven praten en hem vragen of je begrijpt wat hij wil. Het is me altijd verteld, maar ik ben er nooit mee geconfronteerd. Het is niet moeilijk om dit te doen, maar het vereist wel een constante inspanning om eraan te denken.
FH : Het geeft voldoening om te kunnen werken voor een Stichting, voor een goed doel. Ten tweede is dit niet mijn eerste professionele ervaring. En ik heb hier een aantal overeenkomsten gevonden, zoals het feit dat je deel uitmaakt van een klein team waar iedereen een beetje een multifunctionele rol heeft, waardoor je veel leert. En in dit soort structuren moet je autonoom zijn. Je moet ook in staat zijn om dingen zelf te doen en niet aarzelen om dingen voor te stellen en discussies aan te gaan. Ik heb ook veel geleerd over genetica, de hele evolutie van genomica en alle onderzoeksresultaten die daaruit voortkomen. Misschien is dat een gebied waar ik kan werken en iets kan bijdragen.
En het feit dat jullie met drie stagiairs waren, was het moeilijker om te organiseren?
MK : Doordat er drie stagiairs waren, konden we sneller vooruitgang boeken. Het is belangrijk voor het werktempo en de sfeer… we moedigen elkaar aan en motiveren elkaar.
FH : Je moet leren om in een groep te werken. Het is belangrijk om een structuur op te zetten, ieders rol duidelijk te definiëren en de juiste tools te gebruiken om het werk te bundelen. Als we het niet eens worden, kunnen er conflicten ontstaan tussen de verschillende bestanden. Aan het eind van de dag moet je alles samenvoegen zonder de rest kapot te maken. Het is niet altijd gemakkelijk. En als er iets misgaat, is het altijd goed om een beroep te doen op de expertise van anderen. Het is leerzaam voor de toekomst.
Wat vind je van het project waaraan je hebt gewerkt ?
LSL : Dit is een ambitieus project met een nobel doel. Romain en Ludivine vertrouwden ons volledig, waardoor we veel creatieve vrijheid hadden bij het ontwerp. Het was een geweldige ervaring.
MK : Wat het project betreft, vind ik het erg interessant en ik hoop dat het zich zal ontwikkelen om genetisch onderzoek naar met name zeldzame ziekten te bevorderen. Ik zou graag zien dat deze goed gebruikt wordt, want hij heeft potentieel.
FH : Het project waar we aan werken is erg ambitieus. Het mooie is dat we het van A tot Z ontwikkelen. Het is super uitgebreid en maakt gebruik van alles wat we tijdens de cursus hebben geleerd en van nieuwe technologieën. En het was lonend om te werken met een echte ” customer „, met een heel concreet doel. Bijvoorbeeld accommodatie. We moesten de verschillende technologieën en hun kosten onderzoeken voordat we in overleg met het team een keuze maakten. Zo kun je het initiatief nemen.
Interview door Sabine Serck
Klik hier voor een beschrijving van de missie van de drie MIC trainees voor de F101G:
Mic.brussels-stagiairs verbeteren toegang tot genomische gegevens
De 101 Foundation Genomes (F101G) is een non-profit patiëntenorganisatie gevestigd in Brussel met als doel het bevorderen van genomisch onderzoek door het creëren van een unieke genomische database gehost in de cloud voor toegang door verschillende teams van onderzoekers. Deze database bevat volledige genomische gegevens (Whole Genome Sequence) en fenotypische gegevens van patiënten met zeldzame ziekten, hun familieleden en vrijwilligers die aan het onderzoek willen bijdragen. Om de toegang tot de benodigde genomen te vergemakkelijken, werden drie studenten van het MIC’s stageprogramma voor prototypen aangeworven om te helpen bij het ontwikkelen van een online aanvraagsite.
Het menselijk genoom, het genetisch materiaal waaruit het menselijk DNA bestaat, is voor 99,99 % hetzelfde bij elk mens. Het onderzoek van F101G richt zich op de 0,01 % die ieder van ons onderscheidt, maar die ook de oorzaak kan zijn van zeldzame ziekten of de sleutel kan zijn tot de genezing ervan. Om de statistische diepte te verkrijgen die nodig is voor onderzoek, is een grote verzameling genomen nodig. Daarom moet F101G zoveel mogelijk vrijwilligers samenbrengen die willen bijdragen aan het onderzoek om de nodige genomische gegevens te verzamelen. Volgens een enquête uitgevoerd door de Koning Boudewijnstichting is ongeveer 60 % van de Belgische bevolking bereid om toegang te verlenen tot zijn genoom om zo onderzoek te ondersteunen.
Toepassingswebsite
Om concreet invulling te geven aan deze wens om toegang te geven tot genomische data, werkt F101G momenteel aan een tool om het voor vrijwilligers makkelijker te maken om bij te dragen aan genomisch onderzoek. Juist de interface voor deze tool is ontwikkeld door studenten van mic.brussels. Burgers kunnen onderzoek actief steunen door zich te registreren op de site. Het bundelen en toegankelijk maken van de verzamelde gegevens betekent dat verschillende onderzoeksteams buiten een silo aan gegevens kunnen werken. Het doel van F101G is om een cloud-gebaseerde onderzoeksinfrastructuur op te zetten om alle voordelen van open data naar onderzoek te brengen en tegelijkertijd de groei van de biotechnologie te ondersteunen. Als je een van de eersten wilt zijn die zich bij het platform aansluit, nodigen we je uit om je aan te melden voor de nieuwsbrief op f101g.org.
Drie studenten die deelnamen aan de cursus prototyping georganiseerd door mic.brussels werkten samen met F101G om de ontwikkeling van de interface te versnellen en bepaalde technische aspecten met betrekking tot de IT-kant van het project te verbeteren. ” De stagiairs hadden allemaal een verschillend maar complementair profiel „zegt Romain Alderweireldt, oprichter van F101G. ” Tijdens hun stage werkten ze aan het toekomstige openbare platform dat gehost wordt op Azure en ondersteund wordt door Microsoft-technologieën, en dat vrijwilligers in staat moet stellen een actieve bijdrage te leveren aan genomica-onderzoek. Van dinsdag tot donderdag werkten de stagiairs aan de ontwikkeling van de website en bestudeerden daarna de technische problemen en vragen. Op maandag en vrijdag werden ze gecoacht door een team dat bestond uit verschillende IT-experts. Elk van hen had de taak om hun keuzes uit te dagen, hun code te onderzoeken en hen tips of ideeën te geven om hen verder te helpen met hun werk. Deze organisatie bood niet alleen een ondersteunende structuur voor de studenten, maar ook gemoedsrust voor F101G, dat wist dat de ontwikkeling van zijn project gebaat zou zijn bij nauwlettend toezicht, terwijl het toch het laatste woord zou houden in de besluitvorming. „
Expertise in een context plaatsen
Door aan dit project te werken, leerden de stagiairs niet alleen veel over hun vak als ontwikkelaar (de realiteit van projectmanagement, deadlines, technische uitdagingen, enzovoort), maar kregen ze ook de kans om kennis op te doen bij verschillende experts die betrokken waren bij het F101G-project. Dit heeft hen in staat gesteld om hun expertise in de praktijk te brengen in een levensechte context en – hopelijk – zich te onderscheiden in de wetenschappelijke en medische wereld.
Het was ook een echt verrijkende menselijke ervaring, omdat ze konden werken met mensen die een verschil willen maken, aan een project dat binnenkort het leven van een groot aantal patiënten en hun families zou kunnen verbeteren. ” De komende maanden zullen we verbeteringen aan de gebruikersinterface testen. Stagiairs blijven met ons samenwerken aan dit project. We willen absoluut blijven samenwerken met mic.brussels voor toekomstige projecten, niet alleen vanwege de kwaliteit van de geleverde diensten, maar ook omdat de resultaten van onze eerste ervaring meer dan bevredigend waren „, besluit Romain.
