{"id":4272,"date":"2018-10-18T09:38:59","date_gmt":"2018-10-18T07:38:59","guid":{"rendered":"https:\/\/f101g.org\/domar-el-genoma-para-avanzar-10-anos-en-la-investigacion-por-romain-alderweireldt\/"},"modified":"2018-10-18T09:38:59","modified_gmt":"2018-10-18T07:38:59","slug":"domar-el-genoma-para-avanzar-10-anos-en-la-investigacion-por-romain-alderweireldt","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/f101g.org\/es\/domar-el-genoma-para-avanzar-10-anos-en-la-investigacion-por-romain-alderweireldt\/","title":{"rendered":"\u00abDomar el genoma para avanzar 10 a\u00f1os en la investigaci\u00f3n\u00bb por Romain Alderweireldt"},"content":{"rendered":"

Mi esposa y yo estuvimos encantados de aceptar la invitaci\u00f3n de V\u00e9ronique Vrinds para preparar un n\u00famero especial de la revista\u00ab<\/em> Le C\u0153ur & la Main<\/em> \u00bb dedicado al\u00ab<\/em> Projet 101 G\u00e9nomes Marfan<\/em> \u00bb (en adelante P101GM) de la\u00ab<\/em> Fondation 101 G\u00e9nomes<\/em> \u00bb (en adelante F101G).<\/p>\n

El P101GM es fruto del trabajo de la ABSM y, sin duda, no existir\u00eda en su forma actual sin el apoyo de L\u00e9on, R\u00e9mi, Yvonne, Lauriane y V\u00e9ronique.<\/p>\n

El papel crucial de las asociaciones de pacientes<\/h4>\n

Como muchos padres de ni\u00f1os con una enfermedad rara, quer\u00edamos hacer algo con el diagn\u00f3stico de nuestro hijo. Primero nos dirigimos a la ABSM, que nos recibi\u00f3 con los brazos abiertos y nos dio la oportunidad de descubrir la comunidad belga y luego la europea de Marfan a trav\u00e9s de VASCERN.<\/p>\n

En este contexto, nos fuimos interesando poco a poco por la investigaci\u00f3n del s\u00edndrome de Marfan. Hemos descubierto que, adem\u00e1s de apoyar a los pacientes y sus familias, las organizaciones de pacientes desempe\u00f1an un papel esencial en el avance de la investigaci\u00f3n. Un papel de comunicaci\u00f3n y financiaci\u00f3n, como el que desempe\u00f1a la organizaci\u00f3n americana de Marfan(www.marfan.org)<\/a>, pero tambi\u00e9n un papel de apoyo directo a la investigaci\u00f3n, como el que desempe\u00f1a la Asociaci\u00f3n Francesa del S\u00edndrome de Marfan(www.assomarfans.fr)<\/a>.<\/p>\n

Nos interes\u00f3 especialmente la contribuci\u00f3n de la Asociaci\u00f3n Francesa a la creaci\u00f3n de la base de datos UMD-FBN1. UMD-FBN1 es una base de datos de acceso abierto lanzada en 2003 que permite a investigadores de todo el mundo consultarla en l\u00ednea (en la siguiente direcci\u00f3n www.umd.be\/FBN1\/<\/a>) un inventario de 3044 mutaciones patog\u00e9nicas en el gen FBN1 que codifica la prote\u00edna fibrilina 1 en el cromosoma 15, identificado como causante del s\u00edndrome de Marfan.<\/p>\n

Esta base de datos \u00fanica alimenta el trabajo de cientos de cient\u00edficos de todo el mundo y se cita regularmente en la literatura cient\u00edfica sobre el s\u00edndrome de Marfan. Se trata de una herramienta muy importante que lleva muchos a\u00f1os apoyando la investigaci\u00f3n.<\/p>\n

M\u00e1s all\u00e1 de los discursos, a veces un tanto convencionales, UMD-FBN1 nos pareci\u00f3 una prueba concreta del papel crucial que desempe\u00f1an las asociaciones de pacientes en los avances cient\u00edficos.<\/p>\n

A medida que avanz\u00e1bamos en nuestra investigaci\u00f3n con la inestimable ayuda del Dr. Guillaume Smits, nos dimos cuenta de las limitaciones del UMD-FBN1 y r\u00e1pidamente identificamos una laguna – o un vac\u00edo, como lo llama C\u00e9cile Chabot<\/a> – que la comunidad cient\u00edfica quer\u00eda llenar lo antes posible : el acceso al genoma.<\/p>\n

La revoluci\u00f3n gen\u00f3mica<\/h4>\n

Se ha sabido que los especialistas en el s\u00edndrome de Marfan reclaman el acceso a una versi\u00f3n de la enfermedad que sea, de alguna manera, \u00abm\u00e1s eficaz\u00bb. actualizado<\/em> \u00abLa base de datos UMD-FBN1 no s\u00f3lo contendr\u00eda informaci\u00f3n relativa a las mutaciones patog\u00e9nicas observadas en el \u00fanico gen FBN1 afectado en el cromosoma 15, sino que tambi\u00e9n contendr\u00eda informaci\u00f3n observada en todos los genes de los 23 pares de cromosomas que componen el genoma de los pacientes con s\u00edndrome de Marfan.<\/p>\n

Esto significa que, para cada paciente, la base de datos pasar\u00eda de un pat\u00f3geno mutado \u00bb letra \u00ab[1<\/a> ] a… \u00a13.000 millones de letras que representan el ADN de todo un genoma !<\/p>\n

Si este aumento de 3.000.000.000.000 % del volumen de informaci\u00f3n disponible en la base de datos era impensable hasta 2014, hoy ya no lo es, pues los avances tecnol\u00f3gicos y bioinform\u00e1ticos permiten obtener informaci\u00f3n gen\u00f3mica por un coste de secuenciaci\u00f3n de unos 1.000 euros y un volumen de datos de unos 300 gigabytes.<\/p>\n

Para utilizar la met\u00e1fora de la observaci\u00f3n de las galaxias por el Dr Guillaume Smits en la siguiente entrevista<\/a>Con los avances tecnol\u00f3gicos y bioinform\u00e1ticos de los \u00faltimos a\u00f1os, los cient\u00edficos han pasado, en cierto modo, del telescopio de Galileo al telescopio Hubble. \u00a1! Esto ha llevado a la transici\u00f3n de la gen\u00e9tica a – el estudio individual de los genes – a la gen\u00f3mica – el estudio de todos los genes y sus interacciones.<\/p>\n

Es este desarrollo el que el profesor Paul Coucke describe como\u00ab<\/em> revoluci\u00f3n<\/em><\/a> tecnol\u00f3gica  \u00ab<\/a>.<\/p>\n

Y son los beneficios de esta \u00abrevoluci\u00f3n gen\u00f3mica   \u00bb los que queremos poner a disposici\u00f3n de los cient\u00edficos que estudian el s\u00edndrome de Marfan, para ayudarles a comprender mejor la enfermedad. El objetivo es que los terapeutas puedan \u00bb mejor informaci\u00f3n y mejor tratamiento<\/em> \u00ab, como explica la profesora Julie De Backer<\/a>.<\/p>\n

Domar el genoma<\/h4>\n

La menci\u00f3n del genoma alimenta muchas fantas\u00edas, a las que se suman las relativas a los algoritmos que necesariamente intervienen en el tratamiento del extraordinario volumen de datos que representa el genoma.<\/p>\n

Aunque algunos temores son perfectamente leg\u00edtimos, es importante separar los prejuicios de los hechos. Y el P101GM forma parte de este intento de \u00bb domesticar \u00bb el genoma.<\/p>\n

Como se\u00f1ala el Dr. Michel Verboogen, en todo el mundo est\u00e1n floreciendo iniciativas en este sentido. Se pueden encontrar en Islandia, Finlandia, Francia, Estonia, Canad\u00e1, China, Estados Unidos, Dubai y el Reino Unido. Una de las iniciativas m\u00e1s ambiciosas es el \u00bb El Proyecto 100.000 Genomas<\/em> del Reino Unido est\u00e1 movilizando financiaci\u00f3n gubernamental para una serie de enfermedades raras – incluido el s\u00edndrome de Marfan – con el fin de utilizar el genoma con fines de diagn\u00f3stico e investigaci\u00f3n[2]<\/a>.<\/p>\n

Si bien el proyecto brit\u00e1nico sirvi\u00f3 de fuente de inspiraci\u00f3n para la creaci\u00f3n de la Fundaci\u00f3n 101 Genomas<\/em>, esta \u00faltima se diferencia en que, en la fase actual, su acci\u00f3n se centra \u00fanicamente en la investigaci\u00f3n del s\u00edndrome de Marfan (P101GM) y en que depende exclusivamente de financiaci\u00f3n privada.<\/p>\n

En B\u00e9lgica, en el \u00e1mbito institucional, el Centro Federal de Especializaci\u00f3n en Asistencia Sanitaria<\/em> (KCE) public\u00f3 un informe a principios de 2018 en el que ped\u00eda un proyecto piloto para comprender mejor la tecnolog\u00eda, sus costes e implicaciones antes de seguir el ejemplo de las naciones que avanzan en el estudio del genoma[3]<\/a>. En esta fase, entendemos que el KCE sugiere que se mantenga una tecnolog\u00eda intermedia[4<\/a> ] y que se liberen recursos prioritariamente para la oncolog\u00eda en fase asistencial[5]<\/a> y para participar en el diagn\u00f3stico de las enfermedades raras en general. A nuestro entender, el aspecto de la participaci\u00f3n en el avance de la investigaci\u00f3n a\u00fan no se tiene plenamente en cuenta en esta fase.<\/p>\n

Sin embargo, el genoma es objeto de un intenso debate en B\u00e9lgica, y el Ministro de Sanidad ha pedido a la Fundaci\u00f3n Rey Balduino que realice una encuesta de opini\u00f3n p\u00fablica sobre el genoma. En este contexto, la Fundaci\u00f3n Rey Balduino acogi\u00f3 favorablemente nuestra iniciativa, como explicaron Patricia Lanssiers<\/a> y Gerrit Rauws<\/a>.<\/p>\n

Bas\u00e1ndose en su conocimiento del genoma en B\u00e9lgica, la Fundaci\u00f3n Rey Balduino nos sugiri\u00f3 que estructur\u00e1ramos nuestra acci\u00f3n de forma que pudiera reproducirse para otras enfermedades raras. Esto es lo que hemos hecho creando el Fondo 101 Genomas y la Fundaci\u00f3n 101 Genomas, que nos permitir\u00e1n poner en marcha proyectos gen\u00f3micos para otras enfermedades raras, aprovechando la experiencia adquirida con el P101GM, como explica la profesora Anne De Paepe<\/a>.<\/p>\n

Todos los interesados<\/h4>\n

Tambi\u00e9n en el marco de la misi\u00f3n que le ha confiado el Ministro de Sanidad, la Fundaci\u00f3n Rey Balduino ha publicado recientemente un folleto muy interesante titulado\u00ab<\/em> Mi ADN, todos los interesados ?<\/em> \u00ab[6<\/a>].<\/p>\n

Como sugiere su t\u00edtulo, este folleto aborda la cuesti\u00f3n de la responsabilidad individual en relaci\u00f3n con el genoma y la consiguiente ciudadan\u00eda de la humanidad. Esta cuesti\u00f3n, tambi\u00e9n planteada por Bruno Fonteyn<\/a>, es especialmente interesante.<\/p>\n

Cada individuo cuyo genoma se secuencia contribuye a comprender mejor el genoma humano y la forma en que los genes que lo componen interact\u00faan entre s\u00ed.<\/p>\n

Esto plantea cuestiones sobre la responsabilidad de cada individuo de contribuir a una mejor comprensi\u00f3n de la humanidad, para tratarse a s\u00ed mismo y posiblemente tambi\u00e9n a los dem\u00e1s.<\/p>\n

Un ejemplo es la historia de Stephen Lyon Crohn que, como portador de una mutaci\u00f3n en el gen CCR5<\/em>, era gen\u00e9ticamente inmune a la mayor\u00eda de las formas del virus del sida[7]<\/a>. El descubrimiento fortuito de esta mutaci\u00f3n y sus efectos ha conducido al desarrollo de nuevos f\u00e1rmacos[8]<\/a>.<\/p>\n

La revoluci\u00f3n gen\u00f3mica ha abierto nuevas posibilidades para descubrir \u00abnuevas\u00bb enfermedades. genes de superh\u00e9roes<\/em> \u00bb y ampliarlo al campo de las enfermedades raras, como explican Peter O’Donnell y Alisa Herero<\/a>. En otras palabras, descubrir genes modificadores cuya acci\u00f3n contrarreste (o , por el contrario,<\/em> amplifique) el efecto pat\u00f3geno de un gen mutado en el origen de una enfermedad gen\u00e9tica[9<\/a>].<\/p>\n

En este contexto, participar en la aventura del genoma es un poco como donar sangre: puede salvar la vida de alguien y tambi\u00e9n la nuestra.<\/p>\n

El par de datos gen\u00f3micos \/ datos fenot\u00edpicos<\/h4>\n

Queda un punto esencial : consultar los 3.000 millones de bases (letras) que componen los datos gen\u00f3micos es pr\u00e1cticamente in\u00fatil desde el punto de vista que nos interesa.
\n [10]
\n<\/a>.<\/p>\n

Para que sean realmente \u00fatiles y permitan establecer correlaciones cient\u00edficas, los datos gen\u00f3micos deben ir acompa\u00f1ados de datos que describan de la forma m\u00e1s precisa, objetiva y completa posible los rasgos biol\u00f3gicos observables de la persona cuyo genoma se recoge : son los datos fenot\u00edpicos.<\/p>\n

Concretamente, en el caso del P101GM, s\u00f3lo disponiendo del binomio \u00bb datos gen\u00f3micos \/ datos fenot\u00edpicos \u00bb podr\u00e1n los investigadores intentar descubrir la naturaleza precisa de cada gen y\/o de cada mutaci\u00f3n y sus interacciones. Y que entonces podr\u00e1n esperar comprender la gran variabilidad del espectro de trastornos del s\u00edndrome de Marfan – incluso a partir de una mutaci\u00f3n id\u00e9ntica – que no pueden explicar en la actualidad, como ha observado, en particular, la investigadora Aline Verstraeten<\/a>.<\/p>\n

Estos conocimientos permitir\u00e1n controlar y tratar mejor a los pacientes, como explica la profesora Catherine Boileau<\/a>, y responder a las preocupaciones de sus familiares, como ha expresado la Presidenta de la ABSM, V\u00e9ronique Vrinds<\/a>.<\/p>\n

Protecci\u00f3n y anonimizaci\u00f3n de datos personales<\/h4>\n

Los 3.000 millones de letras que componen los datos gen\u00f3micos son ininteligibles para cualquier ser humano sin una interfaz adecuada. Es m\u00e1s, estos datos son pr\u00e1cticamente id\u00e9nticos – a casi el 99 % – para todos los seres humanos. Por lo tanto, es dif\u00edcil considerar que los datos compartidos por todos sean datos personales en sentido estricto. Por otra parte, no cabe duda de que el equilibrio, ahogado en un mar de letras, nos es tan propio que es sencillamente \u00fanico para cada ser humano. El acceso a este balance – y al conjunto del cual puede aislarse – debe ser, por tanto, an\u00f3nimo y seguro.<\/p>\n

Los datos fenot\u00edpicos tambi\u00e9n son dif\u00edciles de tratar, ya que se trata de datos personales que, de hecho, corresponden al expediente m\u00e9dico completo de un individuo. Por tanto, estos datos fenot\u00edpicos deben tratarse con el mismo cuidado que el expediente m\u00e9dico de una persona, que se pondr\u00eda a disposici\u00f3n de los investigadores.<\/p>\n

Al mismo tiempo, debe protegerse el v\u00ednculo con los datos gen\u00f3micos.<\/p>\n

Nos hemos rodeado de un equipo de abogados especializados en temas de protecci\u00f3n de datos personales para establecer un marco jur\u00eddico que garantice el tratamiento seguro de los datos de los pacientes en pleno cumplimiento de la legislaci\u00f3n vigente. A continuaci\u00f3n encontrar\u00e1 las contribuciones de varios miembros de nuestro equipo, entre ellos : Michael Lognoul, asistente en la Universidad de Namur (CRIDS)<\/a> Bruno Fonteyn, abogado del Colegio de Abogados de Bruselas especializado en temas de ciencias de la vida, y C\u00e9cile Chabot, abogada encargada de la transposici\u00f3n del Reglamento General de Protecci\u00f3n de Datos (RGPD) en las empresas.<\/p>\n

Lo que hacemos y lo que no hacemos<\/h4>\n

Para entender la cuesti\u00f3n del acceso seguro a la base de datos gen\u00f3micos cruzados \/ fenot\u00edpica que el P101GM pretende establecer, es esencial entender primero lo que estamos haciendo y lo que no estamos haciendo.<\/p>\n

En el marco del P101GM, la Fundaci\u00f3n 101 Genomas<\/em> se ha propuesto financiar :<\/p>\n